使用R语言进行卡方检验(chi | chisq.test r用法
文|程瑞林(山东大学第二医院足踝外科)来源|(微信公众号)云中瑞麟(ID:ruilinfly)瑞麟导读:对于计量资料,临床医学研究中常用的统计分析方法是t检验;而对于计数资料,卡方检验是一个常用的统计分析方法。最近看到一篇文章,里面分析了骨巨细胞瘤患者术后复发的比例,其中计数资料使用卡方检验(又称χ2检验),下面针对卡方检验的使用方法及其R语言实现方法进行简单介绍。概念卡方检验是一种用途很广的计数资料的假设检验方法,由卡尔·皮尔逊提出。它属于非参数检验的范畴,主要是比较两个及两个以上样本率(构成比)以及两个分...
文|程瑞林(山东大学第二医院足踝外科)来源|(微信公众号)云中瑞麟(ID:ruilinfly)
瑞麟导读:对于计量资料,临床医学研究中常用的统计分析方法是t检验;而对于计数资料,卡方检验是一个常用的统计分析方法。
最近看到一篇文章,里面分析了骨巨细胞瘤患者术后复发的比例,其中计数资料使用卡方检验(又称χ2检验),下面针对卡方检验的使用方法及其R语言实现方法进行简单介绍。
概念卡方检验是一种用途很广的计数资料的假设检验方法,由卡尔·皮尔逊提出。它属于非参数检验的范畴,主要是比较两个及两个以上样本率( 构成比)以及两个分类变量的关联性分析。其根本思想就是在于比较理论频数和实际频数的吻合程度或拟合优度问题。
它在分类资料统计推断中的应用,包括:两个率或两个构成比比较的卡方检验;多个率或多个构成比比较的卡方检验以及分类资料的相关分析等。
可以分为成组比较(不配对资料)和个别比较(配对,或同一对象两种处理的比较)两类。
通常卡方检验的应用主要为:1、 卡方拟合优度检验2、卡方独立性检验
例一我们想知道喝牛奶对感冒发病率有没有影响,以下为数据统计的四格表:
表1 喝牛奶与感冒的相关性
通过简单的统计我们得出喝牛奶组和不喝牛奶组的感冒率为30.94%和25.00%,两者的差别可能是抽样误差导致,也有可能是牛奶对感冒率真的有影响。
为了确定真实原因,我们先假设喝牛奶对感冒发病率是没有影响的,即喝牛奶喝感冒时独立无关的,所以我们可以得出感冒的发病率实际是(43+28)/(43+28+96+84)= 28.29%
所以,理论的四格表应该如下...